اختارت جماعة الإخوان المسلمين د. محمد مرسي ليكون مرشحها في أول انتخابات رئاسية بعد الثورة بعد أن تم استبعاد المهندس خير الشاطر من الترشح بسبب حصوله على عفو صحي مما يمنعه من ممارسة حقوقه السياسية ليفوز بلقب "أول رئيس بعد الثورة" بعد منافسه شرسة .
وشغل مرسي منصب رئيس أكبر حزب سياسي في مصر بعد ثورة 25 يناير 2011 وهو حزب الحرية والعدالة الذي حل بديلا للحزب الوطني بعد تحقيق الأغلبية داخل البرلمان .
نشأ محمد مرسى في قرية العدوة التي ولد فيها 20 أغسطس 1951 بمحافظة الشرقية وسط عائلة مصرية بسيطة لأب فلاح وأم ربة منزل وهو الابن الأكبر لهما وهما متوفيان الآن وله من الأشقاء أختان وثلاثة من الإخوة، تفوق عبر مرحلة التعليم في مدارس محافظة الشرقية، انتقل للقاهرة للدراسة الجامعية .
وعمل معيدا ثم خدم بالجيش المصري "1975 – 1976" كجندي بسلاح الحرب الكيماوية وحصل على ماجستير ودكتوراه في الهندسة من جامعة جنوب كاليفورنيا 1982 في حماية محركات مركبات الفضاء له عشرات الأبحاث في "معالجة أسطح المعادن ".
وانتخب عضوا بنادي هيئة التدريس بجامعة الزقازيق عضو سابق بمكتب إرشاد جماعة الإخوان المسلمين وأحد القيادات السياسية بالجماعة ونائب سابق بمجلس الشعب المصري دورة 2000 - 2005 التي حصل خلالها على أفضل برلماني على مستوى العالم وانتمى للإخوان المسلمين فكرا عام 1977 وتنظيميا أواخر عام 1979 وعمل عضوا بالقسم السياسي بجماعة الإخوان المسلمين منذ نشأته عام 1992 .
وشغل موقع المتحدث الرسمي باسم الكتلة البرلمانية للإخوان وهو صاحب أشهر استجواب في مجلس الشعب عن حادثة قطار الصعيد وأدان الحكومة وخرجت الصحف الحكومية في اليوم التالي تشيد باستجوابه .
وشارك في تأسيس الجبهة الوطنية للتغيير مع د. عزيز صدقي عام 2004، كما شارك في تأسيس الجمعية الوطنية للتغيير مع د. محمد البرادعي عام 2010، كما شارك في تأسيس التحالف الديمقراطي من أجل مصر والذي ضم 40 حزبا وتيارا سياسيا 2011 .
واعتقل عدة مرات حيث قضى سبعة 7 أشهر في السجن بعد أن اعتقل صباح يوم 18 مايو 2006 كما اعتقل في سجن وادي النطرون صباح يوم جمعة الغضب 28 يناير 2011 أثناء ثورة 25 يناير مع 34 من قيادات الإخوان على مستوى المحافظات لمنعهم من المشاركة في جمعة الغضب وقامت الأهالي بتحريرهم يوم 30 يناير